La situación de Incapacidad Temporal (IT) genera lógicas dudas económicas y laborales en los trabajadores. A la preocupación por la salud se suma la incertidumbre sobre cómo afectará la baja a la nómina mensual y a la estabilidad en el empleo.

En este artículo, analizaremos detalladamente la normativa aplicable —basada en la Ley General de la Seguridad Social y la jurisprudencia actual— para explicar cómo se calcula la prestación, qué ocurre con los conceptos de la nómina, cómo afecta a las vacaciones, pagas extra y nuevos complementos salariales, y cómo opera la protección frente al despido.

1. De la nómina regular a la prestación por IT: ¿Qué conceptos cambian?

Una de las mayores confusiones al recibir la primera nómina estando de baja es no entender los conceptos que aparecen en ella. Es fundamental comprender que, jurídicamente, durante una baja médica el contrato de trabajo queda "suspendido". Esto transforma radicalmente la estructura de la nómina:

• Desaparición de los conceptos salariales ordinarios: Por los días que el trabajador permanezca de baja, la empresa deja de abonar el salario estricto. Conceptos habituales como el "Salario Base", el "Plus de Transporte", "Dietas" o "Pluses de asistencia" no se devengan, ya que están vinculados a la prestación efectiva del servicio.
• Aparición del concepto de "Prestación por IT": Esos conceptos ordinarios son sustituidos por uno nuevo, que suele aparecer bajo el nombre de "Prestación por Incapacidad Temporal", "Pago Delegado IT" o similar. Este importe ya no es salario, sino una prestación del sistema de la Seguridad Social (aunque la empresa haga de intermediaria y lo adelante en la nómina).
• El "Complemento IT": Si el Convenio Colectivo obliga a la empresa a complementar la baja, aparecerá una tercera línea en la nómina denominada "Complemento IT", "Mejora voluntaria" o "Complemento de empresa".

Si la baja se inicia a mediados de mes, la nómina será mixta: mostrará los conceptos salariales normales prorrateados por los días trabajados, y los conceptos de Prestación por IT por los días de baja.

2. Concepto clave para el cálculo: La Base Reguladora

Para determinar la cuantía exacta de la prestación por Incapacidad Temporal es imprescindible conocer la "Base Reguladora". La Seguridad Social utiliza la base de cotización bruta del trabajador, no su sueldo neto.

El procedimiento para calcularla, tomando como referencia la nómina del mes anterior a la baja médica, es el siguiente:

1. Identificar la base de cotización: En la parte inferior de la nómina, se debe localizar la "Base de Cotización por Contingencias Comunes" (BCCC) o la "Base de Cotización por Contingencias Profesionales" (BCCP).
2. Calcular la base diaria: Esta cifra se divide entre 30 (salario de devengo mensual) o entre los días efectivos que tenga ese mes (devengo diario).
3. El resultado: La cifra resultante es la Base Reguladora Diaria, sobre la cual se aplicarán los porcentajes legales.

3. Tipos de Incapacidad Temporal y cuantía de la prestación

El porcentaje legal a percibir dependerá del origen de la contingencia médica:

A. Baja por Contingencias Comunes (Enfermedad común o accidente no laboral)

• Días 1 al 3 de baja: No existe derecho a prestación económica por parte de la Seguridad Social (0%).
• Días 4 al 20 de baja: Se percibe el 60% de la base reguladora diaria.
• A partir del día 21 en adelante: La prestación asciende al 75% de la base reguladora.

B. Baja por Contingencias Profesionales (Accidente de trabajo o enfermedad profesional)

• Se percibe el 75% de la base reguladora desde el día siguiente al de la baja médica.
• El salario correspondiente al día íntegro del accidente corre a cargo de la empresa.

4. Dudas frecuentes: Pagas extra, cotizaciones, vacaciones y nuevos pluses

Durante la baja médica surgen grandes preocupaciones relacionadas con la evolución de los derechos laborales. La ley establece lo siguiente:

¿Qué ocurre si genero derecho a un nuevo plus o antigüedad (trienios) durante la baja?

Existe un matiz legal muy importante entre generar el derecho a un complemento salarial y cobrarlo efectivamente en euros mientras se está de baja.

Voy a explicártelo de una forma mucho más sencilla, usando el ejemplo de una "foto".

Imagina que la Seguridad Social te hace una "foto" a tu nómina en octubre de 2023, justo el mes antes de coger una baja en noviembre de 2023. Esa "foto" de tu sueldo de octubre es lo que llamamos la Base Reguladora. En esa foto, tú cobrabas tu salario normal, pero aún no tenías el trienio porque te faltaban unos meses para cumplir los 3 años.

Cuando te vas de baja en noviembre, la ley coge esa foto de octubre y dice: "Durante todo el tiempo que esta persona esté de baja, le vamos a pagar basándonos en esta foto exacta". Es decir, tu sueldo se queda congelado en el tiempo tal y como estaba en octubre.

Para que sepas exactamente cómo funciona la ley si reclamas ese dinero, te lo explico paso a paso:

1. El derecho al trienio sí es tuyo: Si en febrero de 2024, estando de baja, cumples por fin tus 3 años de antigüedad, ese hito es tuyo y la empresa tiene que reconocértelo. El tiempo de baja computa como tiempo trabajado a efectos de antigüedad.
2. Por qué no puedes reclamar el dinero de esos meses: Mientras estás de baja, tú no estás cobrando tu "nómina normal", sino una prestación calculada con esa "foto" (base reguladora) congelada de octubre. La ley establece que los nuevos pluses, trienios o subidas de convenio que ocurran mientras estás de baja no modifican esa base congelada. Por tanto, ni la Seguridad Social ni la Mutua te deben ese dinero de los meses de febrero en adelante, porque ellos han pagado lo correcto según la ley basándose en la foto inicial.
3. La trampa del Convenio Colectivo: Estando de baja, la Seguridad Social solo paga un porcentaje (normalmente el 75%). Muchos convenios obligan a la empresa a poner dinero de su bolsillo para llegar al 100%. Pero, ¿el 100% de qué?
   • Lo que dicen casi todos los convenios: La empresa te paga hasta llegar al 100% de esa "foto" de octubre (tu base reguladora). Como en esa foto no estaba el trienio, la empresa solo te complementa hasta igualar tu sueldo antiguo. Aunque en febrero de 2024 cumplas los 3 años, tu nómina sigue funcionando con la foto antigua y no tienes derecho a reclamar la diferencia.
   • Lo que dicen muy pocos convenios (la excepción): Algunos convenios dicen que la empresa debe pagarte hasta llegar al 100% de lo que cobrarías si estuvieras trabajando hoy. Si tu convenio dijera esto (que es muy raro), la empresa sí habría tenido que actualizar tu nómina en febrero durante la baja y pagarte el trienio.
4. Lo que sí debe ocurrir AHORA (al recibir el alta): Si te dan el alta médica, por ejemplo, el 1 de junio de 2024, tu nómina de ese mes ya será una nómina de alta normal. En esta nómina SÍ tiene que venir incluido y pagado tu trienio de forma íntegra. Ya has "descongelado" tu nómina al volver a trabajar, así que el trienio que generaste en febrero por fin tiene efecto económico. En resumen: no has perdido el trienio, simplemente su cobro ha estado "en pausa".

¿Qué pasa con las pagas extra? ¿Las cobro igual?

La Base de Cotización (usada para calcular tu prestación) ya incluye la parte proporcional de las pagas extraordinarias (la prorrata). Esto significa que, mientras estás de baja, ya estás cobrando una pequeña parte de esas pagas cada mes. Por ello, cuando llegue el mes de cobro de la paga extra (ej. verano o Navidad), no la cobrarás íntegra; la empresa descontará la parte proporcional al tiempo de baja para evitar un doble pago.

¿Sigo cotizando a la Seguridad Social?

Sí, de forma ininterrumpida. Aunque el contrato esté suspendido, la obligación de cotizar se mantiene intacta. En tu nómina verás que se te sigue deduciendo tu parte habitual (cuota obrera) y la empresa continuará ingresando la suya (cuota patronal), garantizando tus derechos para futuras pensiones.

¿Pierdo mis días de vacaciones por estar de baja?

Rotundamente no. El artículo 38.3 del Estatuto de los Trabajadores garantiza que, si tu periodo de vacaciones coincide con una baja médica, podrás disfrutarlas tras recibir el alta. El único límite legal es que no transcurran más de 18 meses a partir del final del año en que se originaron.

5. El papel del Convenio Colectivo: las mejoras voluntarias

Los porcentajes vistos anteriormente son mínimos legales. Como hemos visto, numerosos Convenios Colectivos contemplan "mejoras voluntarias", obligando a las empresas a complementar la prestación pública.

Para determinar exactamente qué conceptos deben incluirse en este complemento, es imperativo analizar la redacción del convenio y la jurisprudencia. En recientes pronunciamientos como la Sentencia del Tribunal Supremo 1282/2025, el Alto Tribunal ha analizado casuísticas complejas sobre qué se considera "retribución fija y periódica" a efectos de complementar la prestación.

6. Extinción del contrato durante la baja: el paso a "pago directo"

Si el contrato finaliza (por fin de obra, vencimiento temporal o despido) mientras el trabajador continúa de baja, este transita a una situación legal denominada "Pago Directo". Seguirá percibiendo la prestación directamente del INSS o de la Mutua:

• Contingencias Comunes: La cuantía pasará a ser la misma que le correspondería si estuviera cobrando la prestación por desempleo. El tiempo que permanezca en esta situación tras el cese del contrato se descontará de su período total de desempleo acumulado (consume paro).
• Contingencias Profesionales: Continuará percibiendo el 75% de su base reguladora y el tiempo en pago directo no consume el período de prestación por desempleo.

7. Protección legal frente al despido durante la Incapacidad Temporal

Tras la entrada en vigor de la Ley 15/2022 integral para la igualdad de trato y la no discriminación, la enfermedad se ha configurado como una situación especialmente protegida.

Despedir a un trabajador teniendo como causa única o principal el mero hecho de estar en situación de Incapacidad Temporal es ilegal. Si la empresa efectúa el despido sin poder acreditar una causa disciplinaria u objetiva real, lícita y ajena a la enfermedad, el despido será calificado judicialmente como NULO, implicando la readmisión obligatoria y el abono de salarios de tramitación.